RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS4BO75351 444 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA4FO95754 770 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-34P06331 123 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD6P59095 220 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
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RABGEF1-201ENST00000284957 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.07□□□□□ -0.96
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RABGEF1-201ENST00000284957 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
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RABGEF1-201ENST00000284957 TEX37Q96LM6 180 aa9.06□□□□□ -0.96
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RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
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RABGEF1-201ENST00000284957 MGRN1O60291 552 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 NPPBP16860 134 aa9.06□□□□□ -0.96
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