RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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CASC3-201ENST00000264645 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.053e-7■□□□□ 8.1
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CASC3-201ENST00000264645 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.77□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GPR152Q8TDT2 470 aa14.77□□□□□ -0.05
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CASC3-201ENST00000264645 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.76□□□□□ -0.05
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CASC3-201ENST00000264645 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 AIG1Q9NVV5 245 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CCNB2O95067 398 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GADD45GO95257 159 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CCNDBP1O95273 360 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 INCA1Q0VD86 236 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OXA1LQ15070 435 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 HKDC1Q2TB90 917 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 GHDCQ8N2G8 530 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.76□□□□□ -0.05
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CASC3-201ENST00000264645 PNCKQ6P2M8 343 aa14.76□□□□□ -0.05
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CASC3-201ENST00000264645 COPS8Q99627 209 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 MGLLQ99685 303 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 KDM4BO94953 1096 aa14.75□□□□□ -0.05
CASC3-201ENST00000264645 DCTP40126 519 aa14.75□□□□□ -0.05
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