RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA24Q86W54 205 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HIPK4Q8NE63 616 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T3Q8NH03 318 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4L1Q8NH43 312 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPEARQ8WU66 669 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UCMAQ8WVF2 138 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EXTL1Q92935 676 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TADA1Q96BN2 335 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PLD4Q96BZ4 506 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB9Q96DX5 294 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SGF29Q96ES7 293 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA3CQ99985 751 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH1Q9BZG8 443 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf4Q9NR00 106 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 STARD5Q9NSY2 213 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ADA2Q9NZK5 511 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SARDHQ9UL12 918 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.9□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ILVBLA1L0T0 632 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 J3KR12 359 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MRASO14807 208 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AZIN1O14977 448 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPT2O15123 496 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC6O43699 453 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AP1G1O43747 822 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NRP2O60462 931 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSL4O60488 711 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KERAO60938 352 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS26AO75436 327 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMPSTE24O75844 475 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SUPT7LO94864 414 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFAIP8O95379 198 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX11BO96011 259 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV3-27P01718 113 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF4P08620 206 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GFAPP14136 432 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 VCLP18206 1134 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CD9P21926 228 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ACP1P24666 158 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNA4P43681 627 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TTPAP49638 278 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 THOP1P52888 689 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OXCT1P55809 520 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DAB2P98082 770 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DSC2Q02487 901 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FOLH1Q04609 750 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 BNIP2Q12982 314 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF460Q14592 562 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP5AQ14642 412 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PDK3Q15120 406 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf22Q49AR2 442 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ5Q5HYK3 327 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 XP32Q5T750 250 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM215Q68D42 235 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKS6Q68DC2 871 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST9Q7L1S5 443 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LGI2Q8N0V4 545 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PELI3Q8N2H9 469 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 STK40Q8N2I9 435 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MIER2Q8N344 545 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.89□□□□□ -1.31
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