RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 MCM10Q7L590 875 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 PLSCR1O15162 318 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 ZBTB7AO95365 584 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 RIPK4P57078 832 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 NEUROD2Q15784 382 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 BTAF1O14981 1849 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 APAF1O14727 1248 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 TEFQ10587 303 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 MRC1P22897 1456 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 PALLDQ8WX93 1383 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 PTGER2P43116 358 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 C1QTNF8P60827 252 aa22.64■■□□□ 1.21
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CLN6-218ENST00000637223 ATG3Q9NT62 314 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 ITGB4P16144 1822 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 TXNRD1Q16881 649 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 PROM2Q8N271 834 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 CASZ1Q86V15 1759 aa22.63■■□□□ 1.21
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CLN6-218ENST00000637223 SYT17Q9BSW7 474 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 KCNQ4P56696 695 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 SLC39A6Q13433 755 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 IFFO2Q5TF58 517 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN6-218ENST00000637223 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.58■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 BTBD11A6QL63 1104 aa22.57■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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CLN6-218ENST00000637223 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 SIK1P57059 783 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN6-218ENST00000637223 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.56■■□□□ 1.2
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CLN6-218ENST00000637223 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN6-218ENST00000637223 UTRNP46939 3433 aa22.49■■□□□ 1.19
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CLN6-218ENST00000637223 ARXQ96QS3 562 aa22.47■■□□□ 1.19
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CLN6-218ENST00000637223 CFAP44Q96MT7 982 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.43■■□□□ 1.18
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CLN6-218ENST00000637223 AK7Q96M32 723 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 IFT57Q9NWB7 429 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 C5P01031 1676 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 ZNF853P0CG23 659 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 GNAI1P63096 354 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 MBIPQ9NS73 344 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN6-218ENST00000637223 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.4■■□□□ 1.18
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