RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611860.1

PRAMEF34P-201, Transcript of PRAME family member 34, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMEF34P, Length 1,447 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ZNF853P0CG23 659 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF34P-201ENST00000611860 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CHL1O00533 1208 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ITGB4P16144 1822 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SLFN5Q08AF3 891 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 FAM182BQ5T319 152 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 BTBD11A6QL63 1104 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PAPPAQ13219 1627 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SBF2Q86WG5 1849 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PIGBQ92521 554 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 MBIPQ9NS73 344 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KCNQ2O43526 872 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ZNF790Q6PG37 636 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF34P-201ENST00000611860 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SLC39A6Q13433 755 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ATG3Q9NT62 314 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 BTAF1O14981 1849 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TRIM37O94972 964 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KCNQ3O43525 872 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PALLDQ8WX93 1383 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 HOXB7P09629 217 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF34P-201ENST00000611860 LY75O60449 1722 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PLSCR1O15162 318 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CCDC125Q86Z20 511 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ZNF428Q96B54 188 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SIK1P57059 783 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KRT24Q2M2I5 525 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 C5P01031 1676 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 VAMP4O75379 141 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 APBA3O96018 575 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TSPYL6Q8N831 410 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TJP1Q07157 1748 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ATP6V1AP38606 617 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 BAG6P46379 1132 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ERBB4Q15303 1308 aa14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 STARD3NLO95772 234 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 USP16Q9Y5T5 823 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ITPK1Q13572 414 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 TXNRD1Q16881 649 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF34P-201ENST00000611860 ILDR2Q71H61 639 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms