RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, human

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC27A1-208	ENST00000600277	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	MRC1	P22897	1456 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	TEF	Q10587	303 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	PIGB	Q92521	554 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SLC27A1-208	ENST00000600277	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.89	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	ITGB4	P16144	1822 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	IL16	Q14005	1332 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	PLSCR1	O15162	318 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	BTAF1	O14981	1849 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SLC27A1-208	ENST00000600277	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	CHL1	O00533	1208 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	GNAI1	P63096	354 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.76	■■■□□ 2.2
SLC27A1-208	ENST00000600277	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	TXNRD1	Q16881	649 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277		E9PSI1	815 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	KCNQ3	O43525	872 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	PROM2	Q8N271	834 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SLC27A1-208	ENST00000600277	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	SIK1	P57059	783 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	KCNQ4	P56696	695 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	LY75	O60449	1722 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC27A1-208	ENST00000600277	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	RREB1	Q92766	1687 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC27A1-208	ENST00000600277	ITPK1	Q13572	414 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	LRP5	O75197	1615 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	HOXB7	P09629	217 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC27A1-208	ENST00000600277	STARD3NL	O95772	234 aa		28.52	■■■□□ 2.16

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