RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599594.1

NUMBL-208, Transcript of NUMB like, endocytic adaptor protein, human

TSL 5

Gene NUMBL, Length 393 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMBL-208	ENST00000599594	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	MCM10	Q7L590	875 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	LY75	O60449	1722 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	RREB1	Q92766	1687 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	APAF1	O14727	1248 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NUMBL-208	ENST00000599594	TEF	Q10587	303 aa		32.07	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.05	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.05	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.04	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.04	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NUMBL-208	ENST00000599594	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.01	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	PROM2	Q8N271	834 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.96	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.96	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.95	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
NUMBL-208	ENST00000599594	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.94	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.93	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	KCNQ4	P56696	695 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	SIK1	P57059	783 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	C5	P01031	1676 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.89	■■■□□ 2.7
NUMBL-208	ENST00000599594	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	CCDC27	Q2M243	656 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	TJP1	Q07157	1748 aa		31.86	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	KCNQ3	O43525	872 aa		31.86	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		31.86	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	ITPK1	Q13572	414 aa		31.83	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.83	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.83	■■■□□ 2.69
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	NGEF	Q8N5V2	710 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.8	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	CHL1	O00533	1208 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.76	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.76	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.76	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	GNAI1	P63096	354 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.73	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	IL16	Q14005	1332 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	AK7	Q96M32	723 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
NUMBL-208	ENST00000599594	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.7	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	STARD3NL	O95772	234 aa		31.66	■■■□□ 2.66
NUMBL-208	ENST00000599594	GNPAT	O15228	680 aa		31.65	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms