RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595023.5

FCHO1-207, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-207ENST00000595023 CAMKK2Q96RR4 588 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-207ENST00000595023 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 PLSCR1O15162 318 aa18.44■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 NHSQ6T4R5 1651 aa18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 SBF2Q86WG5 1849 aa18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 PIGBQ92521 554 aa18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 CABP4P57796 275 aa18.41■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 FKBP8Q14318 412 aa18.41■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 MAP3K5Q99683 1374 aa18.41■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 DOT1LQ8TEK3 1739 aa18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 LGR6Q9HBX8 967 aa18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-207ENST00000595023 TXNRD1Q16881 649 aa18.39■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 PROM2Q8N271 834 aa18.39■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 IFT57Q9NWB7 429 aa18.39■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.38■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 ZNF853P0CG23 659 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 GNAI1P63096 354 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 DCTN1Q14203 1278 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 IL17REQ8NFR9 667 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 PALLDQ8WX93 1383 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 BTAF1O14981 1849 aa18.35■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 MCM10Q7L590 875 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 ATG3Q9NT62 314 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-207ENST00000595023 KCNQ4P56696 695 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 TEFQ10587 303 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 CFAP44Q96MT7 982 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 LRRC4BQ9NT99 713 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 NBPF14Q5TI25 921 aa18.32■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 MBIPQ9NS73 344 aa18.32■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 CACNA1FO60840 1977 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 SIK1P57059 783 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 MRC1P22897 1456 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 SLC39A6Q13433 755 aa18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 ITGB4P16144 1822 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 CHL1O00533 1208 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 STK32BQ9NY57 414 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 RREB1Q92766 1687 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-207ENST00000595023 BCAR3O75815 825 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 ATP6V1AP38606 617 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 BTBD11A6QL63 1104 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 PLIN1O60240 522 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 ITPK1Q13572 414 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 SLC15A2Q16348 729 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 ZNF827Q17R98 1081 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 ZNF428Q96B54 188 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 ZNF790Q6PG37 636 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 AKT1S1Q96B36 256 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 LY75O60449 1722 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 KCNQ3O43525 872 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 VAMP4O75379 141 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-207ENST00000595023 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms