RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
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GIPC1-205ENST00000586027 TRIM35Q9UPQ4 493 aa41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 CAMKK2Q96RR4 588 aa41.34■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 ASAP1Q9ULH1 1129 aa41.34■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 PLSCR1O15162 318 aa41.33■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 TEFQ10587 303 aa41.32■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 ATG3Q9NT62 314 aa41.32■■■■■ 4.21
GIPC1-205ENST00000586027 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
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GIPC1-205ENST00000586027 PROM2Q8N271 834 aa41.28■■■■■ 4.2
GIPC1-205ENST00000586027 PALLDQ8WX93 1383 aa41.28■■■■■ 4.2
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GIPC1-205ENST00000586027 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa41.26■■■■■ 4.2
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GIPC1-205ENST00000586027 PAPPAQ13219 1627 aa41.23■■■■■ 4.19
GIPC1-205ENST00000586027 TXNRD1Q16881 649 aa41.23■■■■■ 4.19
GIPC1-205ENST00000586027 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
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GIPC1-205ENST00000586027 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
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GIPC1-205ENST00000586027 BTBD11A6QL63 1104 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 LRRC4BQ9NT99 713 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 MIS18AQ9NYP9 233 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 KCNQ3O43525 872 aa41.17■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC27Q2M243 656 aa41.16■■■■■ 4.18
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GIPC1-205ENST00000586027 KCPQ6ZWJ8 1503 aa41.14■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 WWC1Q8IX03 1113 aa41.14■■■■■ 4.18
GIPC1-205ENST00000586027 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa41.13■■■■■ 4.18
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GIPC1-205ENST00000586027 ZNF790Q6PG37 636 aa41.13■■■■■ 4.18
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GIPC1-205ENST00000586027 UBR2Q8IWV8 1755 aa41.1■■■■■ 4.17
GIPC1-205ENST00000586027 TTC5Q8N0Z6 440 aa41.09■■■■■ 4.17
GIPC1-205ENST00000586027 KDM3BQ7LBC6 1761 aa41.07■■■■■ 4.17
GIPC1-205ENST00000586027 ITPK1Q13572 414 aa41.07■■■■■ 4.16
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GIPC1-205ENST00000586027 ZNF853P0CG23 659 aa41.02■■■■■ 4.16
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GIPC1-205ENST00000586027 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
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GIPC1-205ENST00000586027 ZNF521Q96K83 1311 aa41.01■■■■■ 4.16
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GIPC1-205ENST00000586027 TAF1LQ8IZX4 1826 aa40.98■■■■■ 4.15
GIPC1-205ENST00000586027 C5P01031 1676 aa40.98■■■■■ 4.15
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GIPC1-205ENST00000586027 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
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GIPC1-205ENST00000586027 SMIM5Q71RC9 77 aa40.8■■■■■ 4.12
GIPC1-205ENST00000586027 AK7Q96M32 723 aa40.8■■■■■ 4.12
GIPC1-205ENST00000586027 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
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