RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 DCAF5Q96JK2 942 aa20.16■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 SLFN5Q08AF3 891 aa20.15■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 PAPPAQ13219 1627 aa20.15■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.15■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 NHSQ6T4R5 1651 aa20.13■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 ZNF853P0CG23 659 aa20.13■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 BTAF1O14981 1849 aa20.13■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 CACNA1FO60840 1977 aa20.12■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 E9PSI1 815 aa20.12■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 IFT57Q9NWB7 429 aa20.12■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 TRIM37O94972 964 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 BAG6P46379 1132 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 GNAI1P63096 354 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 TEFQ10587 303 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 CFAP44Q96MT7 982 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 CHL1O00533 1208 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 CABP4P57796 275 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-209ENST00000567316 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 C5P01031 1676 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 MBIPQ9NS73 344 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 APBA3O96018 575 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 BTBD11A6QL63 1104 aa20.04■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.04■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 RREB1Q92766 1687 aa20.03■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 LY75O60449 1722 aa20.03■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 PLSCR1O15162 318 aa20.03■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.03■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 KCNQ3O43525 872 aa20.02■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 PIGBQ92521 554 aa20.02■□□□□ 0.8
CTU2-209ENST00000567316 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 SLC39A6Q13433 755 aa20.01■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.01■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 PTF1AQ7RTS3 328 aa20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 KCNQ2O43526 872 aa19.99■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 ZNF790Q6PG37 636 aa19.99■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 TJP1Q07157 1748 aa19.99■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.98■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.97■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 KRT24Q2M2I5 525 aa19.97■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 ATG3Q9NT62 314 aa19.97■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.96■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.96■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 TSPYL6Q8N831 410 aa19.96■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.96■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CTU2-209ENST00000567316 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 VAMP4O75379 141 aa19.93■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 PROM2Q8N271 834 aa19.92■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.92■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CTU2-209ENST00000567316 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 HOXB7P09629 217 aa19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 PALLDQ8WX93 1383 aa19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.89■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 TXNRD1Q16881 649 aa19.88■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 NBPF14Q5TI25 921 aa19.87■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 ZNF428Q96B54 188 aa19.87■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.86■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.86■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.84■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms