RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562059.1

BBS2-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 4

Gene BBS2, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-206	ENST00000562059	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	NSD2	O96028	1365 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	IER5L	Q5T953	404 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	FBLN1	P23142	703 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	MEGF6	O75095	1541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS2-206	ENST00000562059	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	KCNQ2	O43526	872 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PANK3	Q9H999	370 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	BTAF1	O14981	1849 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	C7	P10643	843 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS2-206	ENST00000562059	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	EYA1	Q99502	592 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	CYP27B1	O15528	508 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	LY75	O60449	1722 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS2-206	ENST00000562059	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	SEC24B	O95487	1268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PLCG2	P16885	1265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	KDR	P35968	1356 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PHKG2	P15735	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PTGER2	P43116	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS2-206	ENST00000562059	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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