RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 KCNQ3O43525 872 aa27.86■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 BTAF1O14981 1849 aa27.85■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ATG3Q9NT62 314 aa27.84■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.82■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 WWC1Q8IX03 1113 aa27.82■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 BTBD11A6QL63 1104 aa27.8■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 PROM2Q8N271 834 aa27.8■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 PALLDQ8WX93 1383 aa27.8■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 MRC1P22897 1456 aa27.8■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.79■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.77■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.77■■■□□ 2.04
MEIS3-212ENST00000561293 BAG6P46379 1132 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 SOCS7O14512 581 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.74■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 TXNRD1Q16881 649 aa27.74■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 KRT24Q2M2I5 525 aa27.74■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF790Q6PG37 636 aa27.74■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.73■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 SIK1P57059 783 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC125Q86Z20 511 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.7■■■□□ 2.03
MEIS3-212ENST00000561293 PLSCR1O15162 318 aa27.7■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ITPK1Q13572 414 aa27.7■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC27Q2M243 656 aa27.7■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.7■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 MBIPQ9NS73 344 aa27.7■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 SMIM5Q71RC9 77 aa27.69■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ATP6V1AP38606 617 aa27.69■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.68■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF521Q96K83 1311 aa27.67■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 CHL1O00533 1208 aa27.66■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP44Q96MT7 982 aa27.66■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 PAPPAQ13219 1627 aa27.65■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.65■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF853P0CG23 659 aa27.64■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.64■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
MEIS3-212ENST00000561293 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 IFT57Q9NWB7 429 aa27.63■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 NECTIN2Q92692 538 aa27.62■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.61■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 LY75O60449 1722 aa27.61■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 GNAI1P63096 354 aa27.61■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.61■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF827Q17R98 1081 aa27.6■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 WDR63Q8IWG1 891 aa27.6■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 USP16Q9Y5T5 823 aa27.6■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.6■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.59■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.59■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 TSPYL6Q8N831 410 aa27.59■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.58■■■□□ 2.01
MEIS3-212ENST00000561293 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.58■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 GOLGA2Q08379 1002 aa27.57■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.57■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.54■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 PHF14O94880 888 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 A1BGP04217 495 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 RREB1Q92766 1687 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 TJP1Q07157 1748 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 C5P01031 1676 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 IL16Q14005 1332 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 NGEFQ8N5V2 710 aa27.53■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 SLFN5Q08AF3 891 aa27.52■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 ANXA1P04083 346 aa27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms