RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	JUND	P17535	347 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	EP400	Q96L91	3159 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SIAH2	O43255	324 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	EID1	Q9Y6B2	187 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	ERVK-7	P63135	1459 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	SLIT1	O75093	1534 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXA2	O43364	376 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
ATXN3-231	ENST00000554994	USP46	P62068	366 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	SH3BP2	P78314	561 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	USP21	Q9UK80	565 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	SCARF1	Q14162	830 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	BRINP3	Q76B58	766 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCC3	O15438	1527 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	BCAN	Q96GW7	911 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ATRN	O75882	1429 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	C1QTNF8	P60827	252 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	NNT	Q13423	1086 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	C6orf229	H3BNL8	230 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ATF3	P18847	181 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	TET3	O43151	1660 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	MS4A1	P11836	297 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	BAP1	Q92560	729 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	PIK3C2B	O00750	1634 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	MAN1A2	O60476	641 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP2K5	Q13163	448 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP152	O94986	1710 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	ADH1C	P00326	375 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	FDX1	P10109	184 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	TIMP2	P16035	220 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	BAG6	P46379	1132 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	ARID5B	Q14865	1188 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-231	ENST00000554994	UNC13B	O14795	1591 aa		7.12	□□□□□ -1.27

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