RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 CYP27B1O15528 508 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 KCNQ3O43525 872 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 IL2RBP14784 551 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 G2E3Q7L622 706 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 RGS12O14924 1447 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 RGPD5Q99666 1765 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 STRN4Q9NRL3 753 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 BTG4Q9NY30 223 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 FLIIQ13045 1269 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 ZNF790Q6PG37 636 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SMC5Q8IY18 1101 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 CABP4P57796 275 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 ABCA3Q99758 1704 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 NECTIN2Q92692 538 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 MRC1P22897 1456 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 PDE4AP27815 886 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 PIP4K2BP78356 416 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 F6X3S4 739 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SLC39A6Q13433 755 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SKAP1Q86WV1 359 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 GCC1Q96CN9 775 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 BACH2Q9BYV9 841 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 HYPKQ9NX55 129 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 SIRT2Q8IXJ6 389 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CS-209ENST00000547449 GNAI3P08754 354 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 RGS3P49796 1198 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 DISP2A7MBM2 1401 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 EXOC5O00471 708 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 ADAMTS2O95450 1211 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 NUCB1Q02818 461 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PDIA6Q15084 440 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 KSR2Q6VAB6 950 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 MEIS3Q99687 375 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 DCTPP1Q9H773 170 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 GNAI2P04899 355 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 FAM161AQ3B820 660 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 CEP85Q6P2H3 762 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 CERKQ8TCT0 537 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 USP35Q9P2H5 1018 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PHLPP1O60346 1717 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 ALDH1L1O75891 902 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 ERBB4Q15303 1308 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 BEND3Q5T5X7 828 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 USP44Q9H0E7 712 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 USP16Q9Y5T5 823 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 ATP10DQ9P241 1426 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-209ENST00000547449 JCADQ9P266 1359 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms