RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 PIGBQ92521 554 aa23.5■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.5■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.49■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.49■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 PALLDQ8WX93 1383 aa23.49■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.48■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.48■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 MIER1Q8N108 512 aa23.48■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 LGR6Q9HBX8 967 aa23.48■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 PAPPAQ13219 1627 aa23.47■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 C5P01031 1676 aa23.47■■□□□ 1.35
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BRF1-209ENST00000547052 MCM10Q7L590 875 aa23.46■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.46■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.46■■□□□ 1.35
BRF1-209ENST00000547052 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.45■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 APAF1O14727 1248 aa23.45■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.45■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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BRF1-209ENST00000547052 TXNRD1Q16881 649 aa23.44■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 NGEFQ8N5V2 710 aa23.44■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 IL17REQ8NFR9 667 aa23.44■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 BTBD11A6QL63 1104 aa23.42■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.42■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 ATG3Q9NT62 314 aa23.41■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.41■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 DCTN1Q14203 1278 aa23.4■■□□□ 1.34
BRF1-209ENST00000547052 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.39■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 SIK1P57059 783 aa23.39■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 ATP6V1AP38606 617 aa23.38■■□□□ 1.33
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BRF1-209ENST00000547052 STK32BQ9NY57 414 aa23.38■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 ZNF790Q6PG37 636 aa23.37■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.36■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 CCDC27Q2M243 656 aa23.35■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.35■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 C4BP0C0L5 1744 aa23.35■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 SLC39A6Q13433 755 aa23.34■■□□□ 1.33
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BRF1-209ENST00000547052 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.33■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
BRF1-209ENST00000547052 TJP1Q07157 1748 aa23.33■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.32■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 AK7Q96M32 723 aa23.32■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.32■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.32■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 GNAI1P63096 354 aa23.31■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.31■■□□□ 1.32
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BRF1-209ENST00000547052 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.3■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.29■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 STARD3NLO95772 234 aa23.29■■□□□ 1.32
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BRF1-209ENST00000547052 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.29■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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BRF1-209ENST00000547052 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.28■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 IFT57Q9NWB7 429 aa23.28■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 WWC1Q8IX03 1113 aa23.27■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
BRF1-209ENST00000547052 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 KCNQ4P56696 695 aa23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 SLC15A2Q16348 729 aa23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 WDR63Q8IWG1 891 aa23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 IL16Q14005 1332 aa23.26■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.25■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.25■■□□□ 1.31
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BRF1-209ENST00000547052 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.23■■□□□ 1.31
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BRF1-209ENST00000547052 CHL1O00533 1208 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 GNPATO15228 680 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 ITPK1Q13572 414 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 MSH5O43196 834 aa23.21■■□□□ 1.31
BRF1-209ENST00000547052 KCNQ3O43525 872 aa23.2■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 AKT1S1Q96B36 256 aa23.2■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.2■■□□□ 1.3
BRF1-209ENST00000547052 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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