RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL34Q8N239 644 aa7.51□□□□□ -1.21
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CLSTN3-215ENST00000544584 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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CLSTN3-215ENST00000544584 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
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CLSTN3-215ENST00000544584 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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CLSTN3-215ENST00000544584 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6KA4O75676 772 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF14O94880 888 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-215ENST00000544584 RGS19P49795 217 aa7.39□□□□□ -1.23
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.39□□□□□ -1.23
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