RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PROM2Q8N271 834 aa15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 DCAF5Q96JK2 942 aa15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKAR2BP31323 418 aa15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CABP4P57796 275 aa15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PALLDQ8WX93 1383 aa15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 LY75O60449 1722 aa15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.3■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PIGBQ92521 554 aa15.3■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 NEFMP07197 916 aa15.28■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.28■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.27■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.27■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C5P01031 1676 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PAPPAQ13219 1627 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC15A2Q16348 729 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP3K5Q99683 1374 aa15.25■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF827Q17R98 1081 aa15.25■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.25■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 FCHSD2O94868 740 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.23■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 LGR6Q9HBX8 967 aa15.23■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ATG3Q9NT62 314 aa15.23■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP6V1AP38606 617 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 SIK1P57059 783 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TEFQ10587 303 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 AK7Q96M32 723 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.22■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 CASZ1Q86V15 1759 aa15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 LRP5O75197 1615 aa15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZBTB7AO95365 584 aa15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 C4BP0C0L5 1744 aa15.2■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 SPON1Q9HCB6 807 aa15.2■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.2■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 ANP32CO43423 234 aa15.19■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 PHF14O94880 888 aa15.19■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 MRC1P22897 1456 aa15.19■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.19■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC39A6Q13433 755 aa15.18■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.18■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 PITPNM1O00562 1244 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 ITPK1Q13572 414 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 MCM10Q7L590 875 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 GNPATO15228 680 aa15.16■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 IL17REQ8NFR9 667 aa15.16■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.15■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 DCTN1Q14203 1278 aa15.15■□□□□ 0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 NFE2L2Q16236 605 aa15.14■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 MTFR1LQ9H019 292 aa15.14■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 TJP1Q07157 1748 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 NEUROD2Q15784 382 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 MSL1Q68DK7 614 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 KLHL34Q8N239 644 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.13■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 BTBD11A6QL63 1104 aa15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM5Q71RC9 77 aa15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.11■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.11■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 POLD1P28340 1107 aa15.11■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.11■□□□□ 0.01
UBASH3B-208ENST00000533451 MRS2Q9HD23 443 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms