RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524852.1

CAVIN3-202, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene CAVIN3, Length 605 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-202ENST00000524852 TEFQ10587 303 aa21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 ZNF827Q17R98 1081 aa21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 AK7Q96M32 723 aa21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 MAP3K5Q99683 1374 aa21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 LY75O60449 1722 aa21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 MSH5O43196 834 aa21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 MTFR1LQ9H019 292 aa21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 ZBTB7AO95365 584 aa21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3-202ENST00000524852 PAPPAQ13219 1627 aa21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 LRP5O75197 1615 aa21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 IL17REQ8NFR9 667 aa21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 ANP32CO43423 234 aa21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 POLD1P28340 1107 aa21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 SSFA2P28290 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 ITPK1Q13572 414 aa21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 GNPATO15228 680 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-202ENST00000524852 C5P01031 1676 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 SLC39A6Q13433 755 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 NFE2L2Q16236 605 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 MRC1P22897 1456 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 BTBD11A6QL63 1104 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 PHF14O94880 888 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 CASZ1Q86V15 1759 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 ZNF790Q6PG37 636 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 MCM10Q7L590 875 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 C4BP0C0L5 1744 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 ADRA2BP18089 450 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 RPS6KA4O75676 772 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 STARD3NLO95772 234 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 PTGER2P43116 358 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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CAVIN3-202ENST00000524852 RUNDC1Q96C34 613 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-202ENST00000524852 RFC4P35249 363 aa21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 RIPK4P57078 832 aa21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.39■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 DCTN1Q14203 1278 aa21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.38■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.36■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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CAVIN3-202ENST00000524852 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.35■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 MSL1Q68DK7 614 aa21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAVIN3-202ENST00000524852 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 NEUROD2Q15784 382 aa21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3-202ENST00000524852 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 ZPR1O75312 459 aa21.32■■□□□ 1
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CAVIN3-202ENST00000524852 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
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CAVIN3-202ENST00000524852 MRS2Q9HD23 443 aa21.32■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.31■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 SMIM5Q71RC9 77 aa21.31■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.31■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 KLHL34Q8N239 644 aa21.31■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.3■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 A0A087WZG4 1122 aa21.3■■□□□ 1
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CAVIN3-202ENST00000524852 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.3■■□□□ 1
CAVIN3-202ENST00000524852 KCNQ3O43525 872 aa21.29■■□□□ 1
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