RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524048.1

HOXA-AS2-210, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA-AS2, Length 493 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SBF2Q86WG5 1849 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 IL2RBP14784 551 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TXNRD1Q16881 649 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZBTB7AO95365 584 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RIMBP2O15034 1052 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 STK32BQ9NY57 414 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LTN1O94822 1766 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CASZ1Q86V15 1759 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 IP6K1Q92551 441 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 COG3Q96JB2 828 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FBLN1P23142 703 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SLC15A2Q16348 729 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NHSQ6T4R5 1651 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 USP47Q96K76 1375 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 HOXC9P31274 260 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PTGER2P43116 358 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 UTRNP46939 3433 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MICALL2Q8IY33 904 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HOXA-AS2-210ENST00000524048 YY1P25490 414 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 AMPHP49418 695 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PAPPAQ13219 1627 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MYOM1P52179 1685 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SLC24A1O60721 1099 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TMF1P82094 1093 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF827Q17R98 1081 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MEGF6O75095 1541 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RTL1A6NKG5 1358 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FYB1O15117 783 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MTFR1LQ9H019 292 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 BTAF1O14981 1849 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KCNQ4P56696 695 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NBPF4Q96M43 638 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NSD2O96028 1365 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GPR153Q6NV75 609 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CDCA8Q53HL2 280 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SYT17Q9BSW7 474 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ARXQ96QS3 562 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FLT4P35916 1363 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 INSRP06213 1382 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MAP3K5Q99683 1374 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CYP27B1O15528 508 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 POLD1P28340 1107 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.71□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PALLDQ8WX93 1383 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ARSIQ5FYB1 569 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms