RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 EID1Q9Y6B2 187 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 TERF2Q15554 542 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 NFE2L2Q16236 605 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 ACEP12821 1306 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-209ENST00000519674 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.28□□□□□ -0.76
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TRPS1-209ENST00000519674 FAM193AP78312 1265 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-209ENST00000519674 KIF16BQ96L93 1317 aa10.27□□□□□ -0.76
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TRPS1-209ENST00000519674 FAM83GA6ND36 823 aa10.27□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB9Q96C00 473 aa10.27□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 SLIT1O75093 1534 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.26□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 DCTN1Q14203 1278 aa10.26□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 MBIPQ9NS73 344 aa10.26□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 IFT57Q9NWB7 429 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 TBX22Q9Y458 520 aa10.24□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 PTCH1Q13635 1447 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 PEAK1Q9H792 1746 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa10.23□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
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TRPS1-209ENST00000519674 PTMAP06454 111 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 SSH2Q76I76 1423 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 KCNA6P17658 529 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-209ENST00000519674 USP31Q70CQ4 1352 aa10.21□□□□□ -0.77
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