RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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SMIM20-201ENST00000506197 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.37■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 LY75O60449 1722 aa26.34■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
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SMIM20-201ENST00000506197 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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SMIM20-201ENST00000506197 DCAF5Q96JK2 942 aa26.31■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.31■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.31■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC27Q2M243 656 aa26.3■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.3■■□□□ 1.8
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SMIM20-201ENST00000506197 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.28■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF827Q17R98 1081 aa26.28■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 MCM10Q7L590 875 aa26.28■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 ITGB4P16144 1822 aa26.28■■□□□ 1.8
SMIM20-201ENST00000506197 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.28■■□□□ 1.8
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SMIM20-201ENST00000506197 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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SMIM20-201ENST00000506197 MTFR1LQ9H019 292 aa26.24■■□□□ 1.79
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SMIM20-201ENST00000506197 PTGER2P43116 358 aa26.23■■□□□ 1.79
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SMIM20-201ENST00000506197 AKT1S1Q96B36 256 aa26.22■■□□□ 1.79
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SMIM20-201ENST00000506197 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.14■■□□□ 1.78
SMIM20-201ENST00000506197 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.14■■□□□ 1.77
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SMIM20-201ENST00000506197 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.11■■□□□ 1.77
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SMIM20-201ENST00000506197 PIGBQ92521 554 aa26.09■■□□□ 1.77
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SMIM20-201ENST00000506197 SYT17Q9BSW7 474 aa26.06■■□□□ 1.76
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SMIM20-201ENST00000506197 SLC39A6Q13433 755 aa26.04■■□□□ 1.76
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SMIM20-201ENST00000506197 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.03■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 MSH5O43196 834 aa26.03■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF790Q6PG37 636 aa26.03■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.03■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 UTRNP46939 3433 aa26.03■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.02■■□□□ 1.76
SMIM20-201ENST00000506197 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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