RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2B4P23634 1241 aa7.61□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.61□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.61□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.61□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 WIPF1O43516 503 aa7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.6□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 DKK1O94907 266 aa7.59□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.59□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
POLR1B-215ENST00000498054 LILRA1O75019 489 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SSFA2P28290 1259 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 GDF10P55107 478 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF358Q9NW07 568 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SLAIN2Q9P270 581 aa7.58□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 BACH1O14867 736 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 VEGFBP49765 207 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ITPKCQ96DU7 683 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SCARF1Q14162 830 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 TNS4Q8IZW8 715 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SOBPA7XYQ1 873 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 GNRH1P01148 92 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SCNN1AP37088 669 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SCNN1DP51172 638 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 CBLBQ13191 982 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 M0R2N6 131 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 INHAP05111 366 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 MTMR7Q9Y216 660 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 MEN1O00255 615 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 ADH1AP07327 375 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 GMPRP36959 345 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 STK17AQ9UEE5 414 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-215ENST00000498054 H3BM21 787 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ABL1P00519 1130 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 RELBQ01201 579 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 OCLNQ16625 522 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 TBCELQ5QJ74 424 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 IRF7Q92985 503 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP3Q96P20 1036 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PRU2 124 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINB4P48594 390 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 CNKSR1Q969H4 720 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ERBB4Q15303 1308 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 A6NJY4 79 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 WEE1P30291 646 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 PTGIRP43119 386 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SMTNP53814 917 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 TLR1Q15399 786 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 IL2RAP01589 272 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 BMP2P12643 396 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 MEIOBQ8N635 442 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 XAGE2Q96GT9 111 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-215ENST00000498054 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.49□□□□□ -1.21
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