RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 C8orf37Q96NL8 207 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 DIP2BQ9P265 1576 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A087WZG4 1122 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FSD1Q9BTV5 496 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GLI2P10070 1586 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 USP6P35125 1406 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 APPP05067 770 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K5Q99683 1374 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SYNMO15061 1565 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRCP08575 1304 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ERC2O15083 957 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 NEK4P51957 841 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC24BO95487 1268 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 WASHC4Q2M389 1173 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GSE1Q14687 1217 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 STARD3NLO95772 234 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 IL2RBP14784 551 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HYPKQ9NX55 129 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS37DQ86XT2 251 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CNTROBQ8N137 903 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TOM1O60784 492 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 MX1P20591 662 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 GBP4Q96PP9 640 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF790Q6PG37 636 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 USP19O94966 1318 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 FOSBP53539 338 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NFKBIBQ15653 356 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PIK3R4Q99570 1358 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 A1BGP04217 495 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0232Q92628 1395 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRMP28827 1452 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM4AO75164 1064 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NUCB1Q02818 461 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP85Q6P2H3 762 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP7BP35670 1465 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 G3V3G9 751 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PIK3C2BO00750 1634 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 C8orf34Q49A92 452 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF5Q96JK2 942 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 USP16Q9Y5T5 823 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DDB1Q16531 1140 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 INSRP06213 1382 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms