RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 FCHSD2O94868 740 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 AKT1S1Q96B36 256 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 ATG3Q9NT62 314 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 SIK1P57059 783 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 LGR6Q9HBX8 967 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.7■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.7■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 TJP1Q07157 1748 aa27.69■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 NEFMP07197 916 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 ATP6V1AP38606 617 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 SPON1Q9HCB6 807 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB7AO95365 584 aa27.66■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.64■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 ITPK1Q13572 414 aa27.64■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 AK7Q96M32 723 aa27.64■■■□□ 2.02
NELFE-208ENST00000481121 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.63■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 TEFQ10587 303 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 IL17REQ8NFR9 667 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 MTFR1LQ9H019 292 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.61■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.6■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 SLC39A6Q13433 755 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 MSH5O43196 834 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 C4AP0C0L4 1744 aa27.56■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 GNPATO15228 680 aa27.55■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 MCM10Q7L590 875 aa27.55■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.55■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 PHF14O94880 888 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 PTGER2P43116 358 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 SSFA2P28290 1259 aa27.53■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 NFE2L2Q16236 605 aa27.53■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.52■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 DCTN1Q14203 1278 aa27.51■■■□□ 2
NELFE-208ENST00000481121 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.51■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 ANP32CO43423 234 aa27.51■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 ZNF790Q6PG37 636 aa27.5■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.5■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 BTBD11A6QL63 1104 aa27.49■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 SMIM5Q71RC9 77 aa27.48■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.47■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.47■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 POLD1P28340 1107 aa27.46■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.46■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.46■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.45■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RPS6KA4O75676 772 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 MSL1Q68DK7 614 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RUNDC1Q96C34 613 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.43■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 ARXQ96QS3 562 aa27.43■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 ADRA2BP18089 450 aa27.42■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RIPK4P57078 832 aa27.42■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.42■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ3O43525 872 aa27.4■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 CCDC184Q52MB2 194 aa27.39■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 STARD3NLO95772 234 aa27.37■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 RFC4P35249 363 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms