RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.16■□□□□ 0.82
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPN14Q15678 1187 aa20.15■□□□□ 0.82
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.12■□□□□ 0.81
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.06■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASF1Q92558 559 aa20.05■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF4BQ92750 862 aa20.05■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.05■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.05■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRKQ15262 1439 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHTN1A0MZ66 631 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TDO2P48775 406 aa20.04■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCC2Q92887 1545 aa20.03■□□□□ 0.8
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