RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ATG3	Q9NT62	314 aa		23.57	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	23.55	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		23.55	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		23.55	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	CASZ1	Q86V15	1759 aa		23.55	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB7A	O95365	584 aa		23.54	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	23.54	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	23.54	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		23.54	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	PAPPA	Q13219	1627 aa		23.53	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		23.53	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	SIK1	P57059	783 aa		23.53	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	C5	P01031	1676 aa		23.53	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	TEF	Q10587	303 aa		23.52	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	ZNF827	Q17R98	1081 aa		23.52	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	AKT1S1	Q96B36	256 aa		23.52	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		23.52	■■□□□ 1.36
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1A	P38606	617 aa		23.51	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	PTGER2	P43116	358 aa		23.51	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		23.51	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		23.51	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		23.5	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	MTFR1L	Q9H019	292 aa		23.5	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		23.5	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	23.49	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	MCM10	Q7L590	875 aa		23.48	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		23.48	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	MRC1	P22897	1456 aa		23.48	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A6	Q13433	755 aa		23.47	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		23.47	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		23.47	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	DCTN1	Q14203	1278 aa		23.46	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	NFE2L2	Q16236	605 aa		23.46	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	AK7	Q96M32	723 aa		23.46	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		23.46	■■□□□ 1.35
USP19-210	ENST00000465902	C4B	P0C0L5	1744 aa		23.45	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	MSH5	O43196	834 aa		23.45	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	ITPK1	Q13572	414 aa		23.45	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	23.44	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	CCDC184	Q52MB2	194 aa		23.44	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		23.44	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		23.44	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	23.44	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		23.43	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		23.43	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	MRS2	Q9HD23	443 aa		23.43	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		23.42	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		23.42	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	RUNDC1	Q96C34	613 aa		23.42	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		23.41	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	BTBD11	A6QL63	1104 aa		23.41	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	RIPK4	P57078	832 aa		23.41	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	NEUROD2	Q15784	382 aa		23.41	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		23.4	■■□□□ 1.34
USP19-210	ENST00000465902	PHF14	O94880	888 aa		23.39	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	23.39	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		23.39	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	GNPAT	O15228	680 aa		23.38	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	ZNF790	Q6PG37	636 aa		23.38	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	23.38	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	SMIM5	Q71RC9	77 aa		23.37	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	23.37	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		23.37	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	TJP1	Q07157	1748 aa		23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	ARX	Q96QS3	562 aa		23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	23.36	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		23.35	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		23.35	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	SYT17	Q9BSW7	474 aa		23.35	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	23.34	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	KCNQ3	O43525	872 aa		23.34	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	23.34	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		23.34	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	23.34	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		23.33	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	23.33	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		23.33	■■□□□ 1.33
USP19-210	ENST00000465902	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		23.33	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	SSFA2	P28290	1259 aa		23.32	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	23.32	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		23.32	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	23.32	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	APAF1	O14727	1248 aa		23.31	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		23.31	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		23.3	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	POLD1	P28340	1107 aa		23.3	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		23.3	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	23.3	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KA4	O75676	772 aa		23.29	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	STARD3NL	O95772	234 aa		23.29	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	MSL1	Q68DK7	614 aa		23.29	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		23.29	■■□□□ 1.32

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