RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 PAPPAQ13219 1627 aa24.36■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 ATG3Q9NT62 314 aa24.36■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.35■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 TEFQ10587 303 aa24.35■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 KCNQ4P56696 695 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 SIK1P57059 783 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 NFE2L2Q16236 605 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 IL17REQ8NFR9 667 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 C5P01031 1676 aa24.33■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 SLC15A2Q16348 729 aa24.32■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 MRS2Q9HD23 443 aa24.32■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.32■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.3■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.3■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 RUNDC1Q96C34 613 aa24.3■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 ATP6V1AP38606 617 aa24.29■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.28■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 CCDC184Q52MB2 194 aa24.28■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 MCM10Q7L590 875 aa24.28■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 ZNF827Q17R98 1081 aa24.27■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 AKT1S1Q96B36 256 aa24.27■■□□□ 1.48
DDR1-241ENST00000460944 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.26■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.26■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 C4BP0C0L5 1744 aa24.25■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.25■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 SLC39A6Q13433 755 aa24.25■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 DCTN1Q14203 1278 aa24.25■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.25■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.24■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 RIPK4P57078 832 aa24.24■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 AK7Q96M32 723 aa24.24■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 ITPK1Q13572 414 aa24.23■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.23■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 CASZ1Q86V15 1759 aa24.22■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 BTBD11A6QL63 1104 aa24.22■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.21■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.21■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.2■■□□□ 1.47
DDR1-241ENST00000460944 NEUROD2Q15784 382 aa24.2■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 ZNF790Q6PG37 636 aa24.2■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 TJP1Q07157 1748 aa24.19■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.18■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.17■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.17■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.16■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.16■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.16■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 LRP5O75197 1615 aa24.16■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 APAF1O14727 1248 aa24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 GNPATO15228 680 aa24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 MSH5O43196 834 aa24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
DDR1-241ENST00000460944 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.14■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.14■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 PHF14O94880 888 aa24.13■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 SSFA2P28290 1259 aa24.13■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 SPON1Q9HCB6 807 aa24.13■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 KCNQ3O43525 872 aa24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 ZBTB7AO95365 584 aa24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 MTFR1LQ9H019 292 aa24.11■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.1■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.1■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 STARD3NLO95772 234 aa24.09■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 CCER2I3L3R5 266 aa24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 RPS6KA4O75676 772 aa24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
DDR1-241ENST00000460944 ADRA2BP18089 450 aa24.07■■□□□ 1.44
DDR1-241ENST00000460944 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
DDR1-241ENST00000460944 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
DDR1-241ENST00000460944 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.06■■□□□ 1.44
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