RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.64□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OGFOD1Q8N543 542 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.64□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPYDQ12882 1025 aa12.63□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.62□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.61□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB33Q86T24 672 aa12.59□□□□□ -0.39
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAC3Q96MF2 364 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP10AO60312 1499 aa12.57□□□□□ -0.4
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSGA10IPQ3SY00 556 aa12.54□□□□□ -0.4
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARVELD3Q96A59 401 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.51□□□□□ -0.41
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT2BQ93097 391 aa12.51□□□□□ -0.41
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MADDQ8WXG6 1647 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF20Q5VTR2 975 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A2MP01023 1474 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.49□□□□□ -0.41
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