RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441908.6

PQLC3-204, Transcript of PQ loop repeat containing 3, human

TSL 2 BASIC

Gene PQLC3, Length 1,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC3-204	ENST00000441908	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PQLC3-204	ENST00000441908	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PQLC3-204	ENST00000441908	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	MRC1	P22897	1456 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	SOCS7	O14512	581 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	BAG6	P46379	1132 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PQLC3-204	ENST00000441908	KCNQ4	P56696	695 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	PLSCR1	O15162	318 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	LY75	O60449	1722 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	KCNQ3	O43525	872 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	PROM2	Q8N271	834 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PQLC3-204	ENST00000441908	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	SIK1	P57059	783 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PQLC3-204	ENST00000441908	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	RREB1	Q92766	1687 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	ITPK1	Q13572	414 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PQLC3-204	ENST00000441908	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	C5	P01031	1676 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	CHL1	O00533	1208 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	TJP1	Q07157	1748 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	NGEF	Q8N5V2	710 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	GNAI1	P63096	354 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PQLC3-204	ENST00000441908	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	IL16	Q14005	1332 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PQLC3-204	ENST00000441908	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-204	ENST00000441908	AK7	Q96M32	723 aa		31.79	■■■□□ 2.68

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