RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417145.2

GGTLC2-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

TSL 2

Gene GGTLC2, Length 952 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-201ENST00000417145 ATG3Q9NT62 314 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 TEFQ10587 303 aa26.56■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 NFE2L2Q16236 605 aa26.56■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.56■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 IL17REQ8NFR9 667 aa26.55■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 STK32BQ9NY57 414 aa26.55■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 RUNDC1Q96C34 613 aa26.54■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.54■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.53■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 SIK1P57059 783 aa26.53■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 CCDC184Q52MB2 194 aa26.53■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.53■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 PAPPAQ13219 1627 aa26.52■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.52■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 KCNQ4P56696 695 aa26.51■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC15A2Q16348 729 aa26.5■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 MCM10Q7L590 875 aa26.5■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 ATP6V1AP38606 617 aa26.48■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.48■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 RIPK4P57078 832 aa26.47■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.47■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 C5P01031 1676 aa26.47■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 DCTN1Q14203 1278 aa26.46■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.46■■□□□ 1.83
GGTLC2-201ENST00000417145 AKT1S1Q96B36 256 aa26.45■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 BTBD11A6QL63 1104 aa26.44■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC39A6Q13433 755 aa26.44■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF827Q17R98 1081 aa26.44■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.44■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.43■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.42■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 NEUROD2Q15784 382 aa26.42■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 ITPK1Q13572 414 aa26.41■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF790Q6PG37 636 aa26.41■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 AK7Q96M32 723 aa26.41■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 C4BP0C0L5 1744 aa26.4■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.4■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.4■■□□□ 1.82
GGTLC2-201ENST00000417145 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.39■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.38■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 CASZ1Q86V15 1759 aa26.38■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 APAF1O14727 1248 aa26.37■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.37■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.36■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.36■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.35■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 CCER2I3L3R5 266 aa26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.33■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 TJP1Q07157 1748 aa26.33■■□□□ 1.81
GGTLC2-201ENST00000417145 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.33■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 GNPATO15228 680 aa26.32■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.32■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.32■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 SSFA2P28290 1259 aa26.31■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 SPON1Q9HCB6 807 aa26.31■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 MSH5O43196 834 aa26.3■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 KCNQ3O43525 872 aa26.3■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.3■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.3■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 STARD3NLO95772 234 aa26.29■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.29■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.29■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 PHF14O94880 888 aa26.28■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.28■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 ZBTB7AO95365 584 aa26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 MTFR1LQ9H019 292 aa26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.27■■□□□ 1.8
GGTLC2-201ENST00000417145 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GGTLC2-201ENST00000417145 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GGTLC2-201ENST00000417145 RPS6KA4O75676 772 aa26.25■■□□□ 1.79
GGTLC2-201ENST00000417145 ADRA2BP18089 450 aa26.25■■□□□ 1.79
GGTLC2-201ENST00000417145 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms