RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 PDE1AP54750 535 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 PALD1Q9ULE6 856 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 SSH2Q76I76 1423 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 MSH6P52701 1360 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 APBB1O00213 710 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.35■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 POLKQ9UBT6 870 aa26.35■■□□□ 1.81
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CLDN5-201ENST00000403084 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.35■■□□□ 1.81
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CLDN5-201ENST00000403084 HMOX1P09601 288 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 UBE2HP62256 183 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN5-201ENST00000403084 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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CLDN5-201ENST00000403084 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.31■■□□□ 1.8
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CLDN5-201ENST00000403084 AP5Z1O43299 807 aa26.3■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.3■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 HMMRO75330 724 aa26.29■■□□□ 1.8
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CLDN5-201ENST00000403084 KIAA0232Q92628 1395 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 PTPRCP08575 1304 aa26.27■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 IL13P35225 146 aa26.27■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CLDN5-201ENST00000403084 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 CHMLP26374 656 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 KRT24Q2M2I5 525 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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CLDN5-201ENST00000403084 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN5-201ENST00000403084 FBLN1P23142 703 aa26.23■■□□□ 1.79
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CLDN5-201ENST00000403084 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.22■■□□□ 1.79
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CLDN5-201ENST00000403084 TMEM51Q9NW97 253 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN5-201ENST00000403084 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
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CLDN5-201ENST00000403084 F13A1P00488 732 aa26.19■■□□□ 1.78
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CLDN5-201ENST00000403084 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN5-201ENST00000403084 PRAM1Q96QH2 718 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN5-201ENST00000403084 RICTORQ6R327 1708 aa26.17■■□□□ 1.78
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CLDN5-201ENST00000403084 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CLDN5-201ENST00000403084 ATP7BP35670 1465 aa26.16■■□□□ 1.78
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CLDN5-201ENST00000403084 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
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CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 CHL1O00533 1208 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 DIP2BQ9P265 1576 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN5-201ENST00000403084 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.12■■□□□ 1.77
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