RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.05■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.05■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 C5P01031 1676 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC184Q52MB2 194 aa27.03■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 KCNQ4P56696 695 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 SIK1P57059 783 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 NFE2L2Q16236 605 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 SLC15A2Q16348 729 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 STK32BQ9NY57 414 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 AKT1S1Q96B36 256 aa27■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.99■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 TEFQ10587 303 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF827Q17R98 1081 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 RUNDC1Q96C34 613 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.97■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 MCM10Q7L590 875 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 MRS2Q9HD23 443 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 CASZ1Q86V15 1759 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 C4BP0C0L5 1744 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.95■■□□□ 1.91
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.95■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.95■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.95■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 ATP6V1AP38606 617 aa26.94■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 ITPK1Q13572 414 aa26.93■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 DCTN1Q14203 1278 aa26.93■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 SLC39A6Q13433 755 aa26.92■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.91■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 TJP1Q07157 1748 aa26.9■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 RIPK4P57078 832 aa26.9■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF790Q6PG37 636 aa26.89■■□□□ 1.9
CLDN3-201ENST00000395145 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 BTBD11A6QL63 1104 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 LRP5O75197 1615 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.86■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 AK7Q96M32 723 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.84■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CLDN3-201ENST00000395145 APAF1O14727 1248 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 NEUROD2Q15784 382 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.82■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.81■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.81■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 KCNQ3O43525 872 aa26.8■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.8■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 SSFA2P28290 1259 aa26.79■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.79■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.79■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 GNPATO15228 680 aa26.78■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 MTFR1LQ9H019 292 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 SPON1Q9HCB6 807 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.76■■□□□ 1.88
CLDN3-201ENST00000395145 CCER2I3L3R5 266 aa26.76■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.76■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.76■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 RPS6KA4O75676 772 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB7AO95365 584 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.74■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 ADRA2BP18089 450 aa26.73■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 PHF14O94880 888 aa26.72■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 STARD3NLO95772 234 aa26.72■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 SMIM5Q71RC9 77 aa26.72■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms