RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 F6X3S4 739 aa18.65■□□□□ 0.58
ZBED1-201ENST00000381218 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.65■□□□□ 0.58
ZBED1-201ENST00000381218 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.65■□□□□ 0.58
ZBED1-201ENST00000381218 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
ZBED1-201ENST00000381218 PKP1Q13835 747 aa18.64■□□□□ 0.58
ZBED1-201ENST00000381218 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.64■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 MCTP1Q6DN14 999 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NBPF4Q96M43 638 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 FLT4P35916 1363 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 CHL1O00533 1208 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 G2E3Q7L622 706 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 PIK3C2AO00443 1686 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 RBSNQ9H1K0 784 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 FGD1P98174 961 aa18.61■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 TSC1Q92574 1164 aa18.61■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.61■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.6■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 USP31Q70CQ4 1352 aa18.6■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.6■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 ANXA1P04083 346 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 TERF1P54274 439 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 SBNO1A3KN83 1393 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 MPNDQ8N594 471 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 SLC4A2P04920 1241 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 CHRNA2Q15822 529 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 LGR6Q9HBX8 967 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
ZBED1-201ENST00000381218 KIAA0232Q92628 1395 aa18.58■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.58■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 KCNQ3O43525 872 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 IL17REQ8NFR9 667 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 DCTPP1Q9H773 170 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 DYNC1I1O14576 645 aa18.56■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 CDC45O75419 566 aa18.56■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 PTMSP20962 102 aa18.56■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 FAM177BA6PVY3 158 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 GCP02774 474 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 CBX1P83916 185 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 RNF214Q8ND24 703 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ARHGEF10O15013 1369 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 PTPRCP08575 1304 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 CRB1P82279 1406 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 RGS12O14924 1447 aa18.53■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 MEIS3Q99687 375 aa18.53■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM94Q12767 1356 aa18.52■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.52■□□□□ 0.56
ZBED1-201ENST00000381218 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.52■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.52■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 DMTNQ08495 405 aa18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CEP85Q6P2H3 762 aa18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF445P59923 1031 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 MSH6P52701 1360 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SYCE3A1L190 88 aa18.49■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ATF3P18847 181 aa18.49■□□□□ 0.55
ZBED1-201ENST00000381218 HS1BP3Q53T59 392 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95 ms