RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NFE2L2Q16236 605 aa20.33■□□□□ 0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 MRS2Q9HD23 443 aa20.33■□□□□ 0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.33■□□□□ 0.85
PGGT1B-202ENST00000379615 IL17REQ8NFR9 667 aa20.32■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SIK1P57059 783 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 RUNDC1Q96C34 613 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC15A2Q16348 729 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SPON1Q9HCB6 807 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LY75O60449 1722 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 MRC1P22897 1456 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1AP38606 617 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNQ4P56696 695 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPK4P57078 832 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 MCM10Q7L590 875 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB7AO95365 584 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC184Q52MB2 194 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CASZ1Q86V15 1759 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.25■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 AKT1S1Q96B36 256 aa20.24■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD11A6QL63 1104 aa20.23■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 DCTN1Q14203 1278 aa20.23■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC39A6Q13433 755 aa20.22■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 AK7Q96M32 723 aa20.22■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 NEUROD2Q15784 382 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF827Q17R98 1081 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF790Q6PG37 636 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ITPK1Q13572 414 aa20.2■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.2■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 PAPPAQ13219 1627 aa20.19■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 APAF1O14727 1248 aa20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 YY1P25490 414 aa20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 CCER2I3L3R5 266 aa20.17■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.17■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.16■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.16■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 C5P01031 1676 aa20.16■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 GNPATO15228 680 aa20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD3NLO95772 234 aa20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.15■□□□□ 0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 MSH5O43196 834 aa20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGER2P43116 358 aa20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.13■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 SSFA2P28290 1259 aa20.13■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.13■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 C4BP0C0L5 1744 aa20.13■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNQ3O43525 872 aa20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 ADRA2BP18089 450 aa20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 MTFR1LQ9H019 292 aa20.12■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS6KA4O75676 772 aa20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.11■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF14O94880 888 aa20.1■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.1■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 NGEFQ8N5V2 710 aa20.1■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.08■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.08■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms