RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 BTAF1O14981 1849 aa30.81■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 WDR63Q8IWG1 891 aa30.8■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 PIGBQ92521 554 aa30.8■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.8■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.79■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 PAPPAQ13219 1627 aa30.79■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.76■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 IL16Q14005 1332 aa30.75■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM37O94972 964 aa30.75■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF853P0CG23 659 aa30.75■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 CFAP44Q96MT7 982 aa30.74■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 GOLGA2Q08379 1002 aa30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 IFT57Q9NWB7 429 aa30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 BTBD11A6QL63 1104 aa30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 CHL1O00533 1208 aa30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.73■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 UBR2Q8IWV8 1755 aa30.72■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 SLC39A6Q13433 755 aa30.72■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 GNAI1P63096 354 aa30.71■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.7■■■□□ 2.51
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ3O43525 872 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 ILDR2Q71H61 639 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 MBIPQ9NS73 344 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 ATG3Q9NT62 314 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.69■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 SLFN5Q08AF3 891 aa30.67■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF790Q6PG37 636 aa30.67■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 KCPQ6ZWJ8 1503 aa30.67■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.65■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 E9PSI1 815 aa30.65■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 LY75O60449 1722 aa30.64■■■□□ 2.5
PDSS1-201ENST00000376215 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.62■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.62■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 PALLDQ8WX93 1383 aa30.62■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.59■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 KRT24Q2M2I5 525 aa30.58■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 C5P01031 1676 aa30.58■■■□□ 2.49
PDSS1-201ENST00000376215 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.57■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 APBA3O96018 575 aa30.57■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.56■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.56■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.56■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.55■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 TJP1Q07157 1748 aa30.55■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.54■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.53■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 SIK1P57059 783 aa30.53■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 PLSCR1O15162 318 aa30.52■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 TSPYL6Q8N831 410 aa30.52■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.51■■■□□ 2.48
PDSS1-201ENST00000376215 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.51■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.51■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ4P56696 695 aa30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC125Q86Z20 511 aa30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 VSIG10Q8N0Z9 540 aa30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 PROM2Q8N271 834 aa30.48■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 ATP6V1AP38606 617 aa30.47■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 ITPK1Q13572 414 aa30.47■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.46■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.46■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 TXNRD1Q16881 649 aa30.45■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.45■■■□□ 2.47
PDSS1-201ENST00000376215 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.44■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 USP16Q9Y5T5 823 aa30.44■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 RREB1Q92766 1687 aa30.44■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 BAG6P46379 1132 aa30.44■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 HOXB7P09629 217 aa30.43■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 VAMP4O75379 141 aa30.42■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.42■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.4■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
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