RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 CBFA2T2O43439 604 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYD88Q99836 296 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDKL5O76039 1030 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFT140Q96RY7 1462 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYCP1Q15431 976 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBXN4Q92575 508 aa16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 SOGA3Q5TF21 947 aa16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCOA1Q15788 1441 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 METTL24Q5JXM2 366 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 AIDAQ96BJ3 306 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CBX1P83916 185 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 IDI1Q13907 227 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 FOXO3O43524 673 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC102AQ96A19 550 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERLIN1O75477 346 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANXA1P04083 346 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYO6Q9UM54 1294 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPN14Q15678 1187 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMTNL1A8MU46 457 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 NEFHP12036 1026 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 FLIIQ13045 1269 aa16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP5P45974 858 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 BIN1O00499 593 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 URI1O94763 535 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 C8orf76Q96K31 380 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMX1Q9H3N1 280 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 MBIPQ9NS73 344 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABCC11Q96J66 1382 aa16.71■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA1328Q86T90 577 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANO10Q9NW15 660 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAF3Q5VWG9 929 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNRKQ9NRH2 765 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERLIN2O94905 339 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A087WZG4 1122 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms