RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.11■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.1■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 PTGS1P23219 599 aa26.1■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 TIGD1Q96MW7 591 aa26.08■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.08■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 KRT222Q8N1A0 295 aa26.08■■□□□ 1.77
OPN3-201ENST00000366554 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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OPN3-201ENST00000366554 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.07■■□□□ 1.76
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OPN3-201ENST00000366554 KRT24Q2M2I5 525 aa26.01■■□□□ 1.75
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OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26■■□□□ 1.75
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OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.98■■□□□ 1.75
OPN3-201ENST00000366554 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.98■■□□□ 1.75
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OPN3-201ENST00000366554 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.95■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.95■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 HSPA4P34932 840 aa25.95■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 LUZP1Q86V48 1076 aa25.95■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.94■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 POLKQ9UBT6 870 aa25.94■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 CEP135Q66GS9 1140 aa25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 ERICH4A6NGS2 130 aa25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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OPN3-201ENST00000366554 TTC14Q96N46 770 aa25.92■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.92■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.92■■□□□ 1.74
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OPN3-201ENST00000366554 ZNF75DP51815 510 aa25.91■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 TYRO3Q06418 890 aa25.91■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.91■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.91■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.91■■□□□ 1.74
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OPN3-201ENST00000366554 IL25Q9H293 177 aa25.9■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 MAP3K11Q16584 847 aa25.9■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 RILPL2Q969X0 211 aa25.9■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 CBX8Q9HC52 389 aa25.89■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 ST7Q9NRC1 585 aa25.89■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 PTPRCP08575 1304 aa25.89■■□□□ 1.74
OPN3-201ENST00000366554 FAM83GA6ND36 823 aa25.89■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 FBLN1P23142 703 aa25.89■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.89■■□□□ 1.73
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