RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 IFT57Q9NWB7 429 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 SBF2Q86WG5 1849 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 GNAI1P63096 354 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP44Q96MT7 982 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 NHSQ6T4R5 1651 aa36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 BABAM1Q9NWV8 329 aa36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
GIPC1-201ENST00000345425 BTBD11A6QL63 1104 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 E9PSI1 815 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF853P0CG23 659 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 PIGBQ92521 554 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 CHL1O00533 1208 aa36.15■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 KCNQ2O43526 872 aa36.15■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.15■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.15■■■■□ 3.38
GIPC1-201ENST00000345425 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 SLFN5Q08AF3 891 aa36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 KDM3BQ7LBC6 1761 aa36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 MIS18AQ9NYP9 233 aa36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 MBIPQ9NS73 344 aa36.11■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 TTC5Q8N0Z6 440 aa36.1■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 PAPPAQ13219 1627 aa36.09■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF790Q6PG37 636 aa36.09■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 EP400Q96L91 3159 aa36.08■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 BTAF1O14981 1849 aa36.08■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.07■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM37O94972 964 aa36.07■■■■□ 3.37
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A6Q13433 755 aa36.07■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 ATG3Q9NT62 314 aa36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 UBR2Q8IWV8 1755 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 KCNQ3O43525 872 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-201ENST00000345425 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.99■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 PALLDQ8WX93 1383 aa35.98■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.98■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
GIPC1-201ENST00000345425 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 APBA3O96018 575 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 LY75O60449 1722 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 SIK1P57059 783 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 KRT24Q2M2I5 525 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-201ENST00000345425 PLSCR1O15162 318 aa35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 HOXB7P09629 217 aa35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC125Q86Z20 511 aa35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.87■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 TSPYL6Q8N831 410 aa35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V1AP38606 617 aa35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.83■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP4AQ9BY43 222 aa35.83■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 C5P01031 1676 aa35.82■■■■□ 3.33
GIPC1-201ENST00000345425 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.81■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 ILDR2Q71H61 639 aa35.81■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 VAMP4O75379 141 aa35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 BAG6P46379 1132 aa35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 TJP1Q07157 1748 aa35.79■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.79■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.79■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC10Q8IXB1 793 aa35.78■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF428Q96B54 188 aa35.78■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 STARD3NLO95772 234 aa35.76■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa35.76■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 USP16Q9Y5T5 823 aa35.76■■■■□ 3.32
GIPC1-201ENST00000345425 TXNRD1Q16881 649 aa35.76■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 ITPK1Q13572 414 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.311e-8■■■■■ 38.3
GIPC1-201ENST00000345425 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-201ENST00000345425 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.71■■■■□ 3.31
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