RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 NF2P35240 595 aa14.92□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.92□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 STK38Q15208 465 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 NEFHP12036 1026 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 AAMPQ13685 434 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.91□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 CCP110O43303 1012 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 HIP1O00291 1037 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 STK3Q13188 491 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 AACSQ86V21 672 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC7Q96M83 1385 aa14.9□□□□□ -0.02
XIRP1-201ENST00000340369 MBD3O95983 291 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CA8P35219 290 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC69A6NI79 296 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SERPINC1P01008 464 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 NOS1P29475 1434 aa14.89□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PDCP20941 246 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 F8W031 263 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SRGAP3O43295 1099 aa14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ANKRD62A6NC57 917 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 OGFOD1Q8N543 542 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SLF2Q8IX21 1173 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 AIDAQ96BJ3 306 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ERLIN2O94905 339 aa14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 IL2RBP14784 551 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 MCM2P49736 904 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SLC5A1P13866 664 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 DEF6Q9H4E7 631 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 RABEP1Q15276 862 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC96Q2M329 555 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ZMYM3Q14202 1370 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC181Q5TID7 509 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 VEZTQ9HBM0 779 aa14.85□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC66A2RUB6 948 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 GNPATO15228 680 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 TNMDQ9H2S6 317 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 FCHSD2O94868 740 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 MPNDQ8N594 471 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ME1P48163 572 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 JMYQ8N9B5 988 aa14.84□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 NFE2L2Q16236 605 aa14.83□□□□□ -0.03
XIRP1-201ENST00000340369 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 STIM1Q13586 685 aa14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 GCC1Q96CN9 775 aa14.83□□□□□ -0.04
XIRP1-201ENST00000340369 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms