RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.27■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.27■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.26■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 MRC1P22897 1456 aa35.25■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 TXNRD1Q16881 649 aa35.25■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 MCM10Q7L590 875 aa35.25■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.24■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 LY75O60449 1722 aa35.23■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 PROM2Q8N271 834 aa35.23■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 ATG3Q9NT62 314 aa35.23■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 APAF1O14727 1248 aa35.22■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 NEUROD2Q15784 382 aa35.22■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.22■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 RREB1Q92766 1687 aa35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 PALLDQ8WX93 1383 aa35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 DCTN1Q14203 1278 aa35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CRIP1-201ENST00000330233 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CRIP1-201ENST00000330233 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CRIP1-201ENST00000330233 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.14■■■■□ 3.22
CRIP1-201ENST00000330233 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD11A6QL63 1104 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 SIK1P57059 783 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF14Q5TI25 921 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.12■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A6Q13433 755 aa35.1■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.1■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 PAPPAQ13219 1627 aa35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF790Q6PG37 636 aa35.08■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.08■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V1AP38606 617 aa35.07■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.07■■■■□ 3.21
CRIP1-201ENST00000330233 KCNQ4P56696 695 aa35.06■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC27Q2M243 656 aa35.06■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 NGEFQ8N5V2 710 aa35.06■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.05■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 UBR2Q8IWV8 1755 aa35.04■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.02■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 STK32BQ9NY57 414 aa35.02■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 C5P01031 1676 aa35.01■■■■□ 3.2
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.01■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 FMNL2Q96PY5 1086 aa35■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 MIS18AQ9NYP9 233 aa35■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 KCPQ6ZWJ8 1503 aa34.99■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 SLC15A2Q16348 729 aa34.98■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 KCNQ3O43525 872 aa34.97■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 ITPK1Q13572 414 aa34.97■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 WWC1Q8IX03 1113 aa34.97■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.96■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 AKT1S1Q96B36 256 aa34.96■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 TSPYL4Q9UJ04 414 aa34.96■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.95■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CRIP1-201ENST00000330233 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 HEG1Q9ULI3 1381 aa34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 CHL1O00533 1208 aa34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00116Q8NCU8 138 aa34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP44Q96MT7 982 aa34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 C4BP0C0L5 1744 aa34.92■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 GNAI1P63096 354 aa34.91■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.91■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF827Q17R98 1081 aa34.9■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC10Q8IXB1 793 aa34.9■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 AK7Q96M32 723 aa34.9■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 IFT57Q9NWB7 429 aa34.9■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 TJP1Q07157 1748 aa34.9■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 WDR63Q8IWG1 891 aa34.89■■■■□ 3.18
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF853P0CG23 659 aa34.88■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 STARD3NLO95772 234 aa34.87■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 IL16Q14005 1332 aa34.87■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa34.87■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.86■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 CRKLP46109 303 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.84■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.83■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 MBIPQ9NS73 344 aa34.82■■■■□ 3.17
CRIP1-201ENST00000330233 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.82■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 GNPATO15228 680 aa34.81■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC87Q9NVE4 849 aa34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms