RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.7□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 ATP7BP35670 1465 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PDE1AP54750 535 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 HMMRO75330 724 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PALD1Q9ULE6 856 aa14.69□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CHL1O00533 1208 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 DTNBO60941 627 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF445P59923 1031 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 TMX3Q96JJ7 454 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 FGD1P98174 961 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.68□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 RGS12O14924 1447 aa14.67□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 MAP7D2Q96T17 732 aa14.67□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.66□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 KCNA6P17658 529 aa14.65□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PSME1Q06323 249 aa14.65□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PDE4CQ08493 712 aa14.65□□□□□ -0.06
NLRC3-201ENST00000324659 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 PTPRCP08575 1304 aa14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 TSC1Q92574 1164 aa14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 GNAI2P04899 355 aa14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 CBX1P83916 185 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 STK31Q9BXU1 1019 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 MX1P20591 662 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.63□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 MCCP23508 829 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 FAM177BA6PVY3 158 aa14.61□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 IGSF3O75054 1194 aa14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 IL25Q9H293 177 aa14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 RICTORQ6R327 1708 aa14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 PLCB2Q00722 1185 aa14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 FLIIQ13045 1269 aa14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 CHMLP26374 656 aa14.59□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 REREQ9P2R6 1566 aa14.59□□□□□ -0.07
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 BRD1O95696 1058 aa14.58□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 EYA1Q99502 592 aa14.58□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 KIAA0232Q92628 1395 aa14.58□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.57□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 TSPY26PQ9H489 355 aa14.57□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.57□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 MBD3O95983 291 aa14.57□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ANXA1P04083 346 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 USP48Q86UV5 1035 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CRB1P82279 1406 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 DYNC1I1O14576 645 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CPA1P15085 419 aa14.56□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 GNAI3P08754 354 aa14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 DLC1Q96QB1 1528 aa14.55□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NLRC3-201ENST00000324659 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms