RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 CASZ1Q86V15 1759 aa26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.63■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB7AO95365 584 aa26.62■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 PTGER2P43116 358 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 PROM2Q8N271 834 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 STK32BQ9NY57 414 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 LY75O60449 1722 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 APAF1O14727 1248 aa26.6■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 LGR6Q9HBX8 967 aa26.6■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 RIPK4P57078 832 aa26.59■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.58■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 IL17REQ8NFR9 667 aa26.58■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.58■■□□□ 1.85
RALGPS1-202ENST00000319107 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.57■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.57■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 CABP4P57796 275 aa26.56■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 NEUROD2Q15784 382 aa26.56■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 MCM10Q7L590 875 aa26.56■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 SYT17Q9BSW7 474 aa26.56■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.56■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 DCTN1Q14203 1278 aa26.55■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC15A2Q16348 729 aa26.55■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 MTFR1LQ9H019 292 aa26.55■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 PIGBQ92521 554 aa26.54■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.53■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 TEFQ10587 303 aa26.53■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.53■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.53■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.51■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.51■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 C1QTNF8P60827 252 aa26.5■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 UTRNP46939 3433 aa26.49■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC27Q2M243 656 aa26.49■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 PALLDQ8WX93 1383 aa26.48■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.48■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 CHD4Q14839 1912 aa26.47■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.47■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.47■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 NGEFQ8N5V2 710 aa26.46■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.46■■□□□ 1.83
RALGPS1-202ENST00000319107 C5P01031 1676 aa26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 ARXQ96QS3 562 aa26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 ATG3Q9NT62 314 aa26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 TJP1Q07157 1748 aa26.45■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.44■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 WWC1Q8IX03 1113 aa26.42■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 BTBD11A6QL63 1104 aa26.41■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC39A6Q13433 755 aa26.4■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.4■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF827Q17R98 1081 aa26.39■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF790Q6PG37 636 aa26.39■■□□□ 1.82
RALGPS1-202ENST00000319107 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.38■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNQ4P56696 695 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 AKT1S1Q96B36 256 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF521Q96K83 1311 aa26.37■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.36■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 SIK1P57059 783 aa26.36■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 GPR162Q16538 588 aa26.36■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.36■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 C4BP0C0L5 1744 aa26.35■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 IFT57Q9NWB7 429 aa26.35■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 IL16Q14005 1332 aa26.35■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNQ3O43525 872 aa26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 WDR63Q8IWG1 891 aa26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 CFAP44Q96MT7 982 aa26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.34■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 CHL1O00533 1208 aa26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF853P0CG23 659 aa26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 IFFO2Q5TF58 517 aa26.33■■□□□ 1.81
RALGPS1-202ENST00000319107 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.33■■□□□ 1.8
RALGPS1-202ENST00000319107 GNAI1P63096 354 aa26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms