RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2HP62256 183 aa27.33■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PALD1Q9ULE6 856 aa27.33■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLKQ9UBT6 870 aa27.32■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.32■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.31■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMMRO75330 724 aa27.31■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSH2Q76I76 1423 aa27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC3O15438 1527 aa27.3■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AP5Z1O43299 807 aa27.29■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MSH6P52701 1360 aa27.28■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.28■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGSF3O75054 1194 aa27.28■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE4CQ08493 712 aa27.28■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.28■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.27■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLCB2Q00722 1185 aa27.27■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MEIS3Q99687 375 aa27.27■■□□□ 1.96
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.26■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.26■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.25■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRCP08575 1304 aa27.25■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLFN14P0C7P3 912 aa27.24■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMLP26374 656 aa27.24■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMTNL1A8MU46 457 aa27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIK3C2BO00750 1634 aa27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL13P35225 146 aa27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STK26Q9P289 416 aa27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.22■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT24Q2M2I5 525 aa27.22■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA0232Q92628 1395 aa27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRMP28827 1452 aa27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPC24Q8NBT2 197 aa27.21■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBLN1P23142 703 aa27.19■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM83GA6ND36 823 aa27.18■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STX6O43752 255 aa27.17■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 F13A1P00488 732 aa27.17■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CABP1Q9NZU7 370 aa27.17■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC192P0DO97 292 aa27.16■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FIBPO43427 364 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYT1P21579 422 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTGS1P23219 599 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSPA4P34932 840 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RILPL2Q969X0 211 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF18AQ8NI77 898 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRAM1Q96QH2 718 aa27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCTN1Q14203 1278 aa27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TERF2Q15554 542 aa27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC66A2RUB6 948 aa27.14■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK19Q9BWU1 502 aa27.13■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STAP2Q9UGK3 403 aa27.13■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.13■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.12■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.12■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.11■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHL1O00533 1208 aa27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNNT1P13805 278 aa27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GGT6Q6P531 493 aa27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.1■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM193AP78312 1265 aa27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT222Q8N1A0 295 aa27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC14Q96N46 770 aa27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.09■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNAI2P04899 355 aa27.08■■□□□ 1.93
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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