RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273739.9

SLIT2-201, Transcript of slit guidance ligand 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLIT2, Length 5,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2-201ENST00000273739 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 SOGA3Q5TF21 947 aa14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 AIDAQ96BJ3 306 aa14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 EYA3Q99504 573 aa14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 PSMA5P28066 241 aa14.74□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 TSPOAP1O95153 1857 aa14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 CHMP4BP1P59074 171 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 PANK1Q8TE04 598 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 DCAF5Q96JK2 942 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 IFT57Q9NWB7 429 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 CABP5Q9NP86 173 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.72□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT2-201ENST00000273739 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 CNBD1Q8NA66 436 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 H0YIN7 160 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 FLT4P35916 1363 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 HLA-DOAP06340 250 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 LTKP29376 864 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 MAP3K12Q12852 859 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 SLC39A6Q13433 755 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 IP6K1Q92551 441 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 BAG3O95817 575 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 CCDC69A6NI79 296 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 PDE4AP27815 886 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ZNF76P36508 570 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 BCS1LQ9Y276 419 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 KDM4AO75164 1064 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 NPATQ14207 1427 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 VEZTQ9HBM0 779 aa14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 FOSBP53539 338 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 GSTO1P78417 241 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.66□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 SCLT1Q96NL6 688 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT2-201ENST00000273739 ABCC11Q96J66 1382 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 F8W031 263 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 ABCC1P33527 1531 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 PTPRKQ15262 1439 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 TRIM37O94972 964 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 TNIP1Q15025 636 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 HOXC9P31274 260 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 CCDC96Q2M329 555 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 PAF1Q8N7H5 531 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 GCC1Q96CN9 775 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT2-201ENST00000273739 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms