RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.92■■□□□ 1.26
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USP18-201ENST00000215794 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.9■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.89■■□□□ 1.26
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USP18-201ENST00000215794 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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USP18-201ENST00000215794 MEGF6O75095 1541 aa22.88■■□□□ 1.25
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USP18-201ENST00000215794 SLC4A3P48751 1232 aa22.87■■□□□ 1.25
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USP18-201ENST00000215794 RGS12O14924 1447 aa22.84■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 SLIT2O94813 1529 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP18-201ENST00000215794 FBXO41Q8TF61 875 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP18-201ENST00000215794 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP18-201ENST00000215794 LNPKQ9C0E8 428 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP18-201ENST00000215794 IL17REQ8NFR9 667 aa22.78■■□□□ 1.24
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USP18-201ENST00000215794 GLI3P10071 1580 aa22.63■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.62■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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