Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gipc1Q9Z0G0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gipc1Q9Z0G0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms