Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms