Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms