Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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