Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms